记者2日从中国科学院昆明动物研究所等获悉，由我国科学家发起并主导的灵长类基因组计划在灵长类演化研究上取得重大进展，厘清了灵长类动物的系统发育关系；揭示了不同灵长类动物的遗传多样性特征和进化历史；解析了灵长类动物大脑、体型、骨骼、感官、食性等复杂性状进化的遗传机制等。8篇相关研究论文以专刊形式在线发表于国际期刊《科学》。

非人灵长类是研究人类复杂性状起源与进化的关键类群，但目前灵长类动物遗传信息解析进展缓慢。为了填补灵长类遗传资源和进化生物学机制方面的不足，中国科学院昆明动物研究所2018年发起灵长类基因组计划（PGP），依托模式动物表型与遗传研究国家重大科技基础设施（灵长类设施），围绕灵长类大尺度比较基因组学和复杂性状演化、基因组多样性、社会系统复杂性、物种形成、疾病变异位点的演化等重大科学问题开展了系列原创性研究。


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其中，最为突出的是研究团队开展了迄今为止规模最大、物种最全的灵长类比较基因组学研究，重构了灵长类动物基因组的演化历史，确定系列与人类复杂表型和灵长类不同谱系表型多样性演化有关的关键候选基因和结构变异，组装和释放的灵长类27个关键支系的高质量长读长三代参考基因组，对未来生物医学研究和灵长类动物遗传资源的开发、利用和保护研究具有十分重要的意义。

研究团队通过对现生7属55种亚洲叶猴上千种环境变量的综合生态因子分析，构建了迄今为止最全的亚洲生态数据集，结果显示生活在寒冷环境中的现生物种，更倾向于形成大的社群。通过进一步祖先分布重建，结合构建的亚洲古地质、古环境数据集，发现两次社会聚合都发生在历史寒冷时期以及气候寒冷的地区，表明寒冷效应可能促进了社会聚合，是重层社会演化的一个关键生态因子，明确了社会演化的环境动力。

此外，研究团队用多学科交叉融合的方法，从行为、生态、遗传等多个维度，全面解析亚洲叶猴重层社会的起源、演化和形成机制，被认为是“迄今为止关于动物社会演化最全面的研究”，“为社会演化领域开辟了一条新的道路”。研究还发现了灵长类动物杂交成种事件；发现和解析了灵长类艾滋病疾病模型机制，打破了制约艾滋病研究的关键瓶颈；同时，解析了灵长类支系特异性加速演化元件的功能，为深入了解灵长类动物演化，尤其为人类大脑独特演化发育模式研究提供了新见解。

这些发现，对灵长类动物多样性保护、遗传资源的开发和利用具有重要指导意义，也为人类特殊性状的起源、发育以及疾病医学研究提供了重要遗传学材料和候选分子靶标。

灵长类基因组计划联盟由浙江大学生命演化研究中心的张国捷教授团队、中国科学院昆明动物研究所吴东东研究员团队、西北大学齐晓光教授团队、云南大学于黎研究员团队等联合国内外多个研究中心组成。

（科技日报记者 赵汉斌 史俊斌 通讯员 朱悦 魏梦鸽）

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